Très bon tuto pour le renouvellement d'un certificat Let's Encrypt quand on ne dispose que d'un accès FTP à son serveur.
Sinon il y a aussi ce guide dont j'avais parlé pour mettre en place un renouvellement automatique :
https://www.digitalocean.com/community/tutorials/how-to-secure-apache-with-let-s-encrypt-on-ubuntu-18-04